Durchgehende internationale Züge verkehren auf den folgenden Verbindungen:
ICE Verbindungen
Hamburg - Hannover - Frankfurt - Mannheim - Karlsruhe - Freiburg (Brsg) - Basel - Zürich (diese ICE Züge verkehren im 2-Stunden Takt - eine Relation verkehrt ab Kiel)
Berlin - Kassel - Frankfurt - Mannheim - Karlsruhe - Freiburg (Brsg) - Basel - Bern - Interlaken
EC Verbindungen
Stuttgart - Horb - Singen - Schaffhausen - Zürich
München - Memmingen - Lindau - Bregenz - St. Gallen - Zürich
Nachtzüge
Berlin / Hamburg - Hannover - Mannheim - Basel - Zürich
Regionalverkehr grenzüberschreitend
Basel - Rheinfelden (Baden) - Waldshut - Schaffhausen - Singen
Konstanz - Kreuzlingen - Weinfelden / St. Gallen
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